Την κατεδάφιση του κτιρίου που βρίσκεται στην περιοχή του «Ταρσανά» ( πρώην ΒΑΡΚΑ ) αποφάσισε το Δημοτικό Λιμενικό Ταμείο Σάμου .
Σύμφωνα με το σκεπτικό του Ταμείου, τα τελευταία 15 χρόνια το κτίριο χρησιμοποιείται κυριως ως αποθηκευτικός χώρος, στεγάζοντας τους χώρους υγιεινής του λιμένα Πυθαγορείου.
Ωστόσο λόγω έλλειψης προσωπικού δεν λειτουργεί και παραμένει σφραγισμένο, ενώ με το πέρασμα του χρόνου έχει πλέον μετατραπεί σε χώρο συγκέντρωσης άχρηστων υλικών και σκουπιδιών.
Το κτίριο θα απομακρυνθεί και θα αντικατασταθεί από έναν προκατασκευασμένο οικίσκο που θα χρησιμοποιηθεί ως επιβατικός σταθμός για τα πλοιάρια που έρχονται απο την Τουρκία .
Επίσης σε αυτό θα στεγαστούν οι τελωνειακές και αστυνομικές αρχές του Πυθαγορείου. Τέλος θα αποτελεί ένα αξιοπρεπές περιβάλλον για το επιβατικό κοινό του λιμένα.
Το έργο προμήθειας και τοποθέτησης λυόμενου οικίσκου έχει ενταχθεί στο ΠΔΕ 2017 του Υπουργείου Ναυτιλίας και Νησιωτικής Πολιτικής ,προϋπολογισμού 117.000€.
